移植到子宫腔内的胚胎未能成功着床，对患者来说是一个很大的打击，也困扰着生殖中心的医生们。甚至有些不孕不育患者屡屡失败，除了花钱之外，对患者的身心也造成很大的创伤。植入的胚胎不能成功着床的原因，始终是一个令人困扰的、备受期待的话题。现在认为，这可能主要与以下一些因素有关。
子宫内膜接受能力不足
(1) 子宫腔的异常病变，如子宫先天性畸形（双角子宫、纵隔子宫）、子宫内膜息肉、子宫内膜炎和子宫肌瘤等。
(2)子宫内膜薄：流产后多次清宫、月经不调（月经连续不断）或血液循环不良均可引起子宫内膜薄。
(3) 输卵管内液体返回子宫腔：输卵管内液体是由于输卵管的伞端（尾端）流向子宫腔的阻塞造成的。子宫腔内持续积液可导致胚胎植入失败。
(4) 子宫内膜细胞分泌的粘附分子的数量和质量异常等。
胚胎本身的缺陷
在重复试管婴儿的案例中，发现胚胎染色体异常的比例高达60%，所以很多植入子宫的胚胎都是因为胚胎本身的染色体异常而无法植入。这些染色体异常的胚胎有时看起来细胞大小正常，分裂速度也正常，在胚胎分类表上是良好的1级或2级胚胎。而且，妇女的年龄越大，胚胎异常的机会就越大。此外，由于妇女的年龄和体外培养环境造成的透明带增厚和变硬，会损害胚胎，导致胚胎植入失败。